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Discovery Studio 2024,開啟你的藥物設(shè)計之旅!

Discovery Studio 2024,開啟你的藥物設(shè)計之旅!

作者:
北京泰科
2023/12/14
瀏覽量
【摘要】:
增強(qiáng)新功能上線

新功能:

藥效團(tuán)

(1)PharmaDB Profiler協(xié)議報告每個獨(dú)特功能的映射詳細(xì)信息;

(2)PharmaDB Filter協(xié)議可以使用pdb_id或scpdb_id進(jìn)行過濾;

 

客戶端

核酸鏈的主鏈可以在Discovery Studio客戶端中通過殘基進(jìn)行著色;

 

增強(qiáng)功能:

(1)Perl腳本語言升級到5.36.0;

 

(2)通過殘基對核酸主鏈進(jìn)行著色;

 

(3)藥效團(tuán)理論的幫助信息現(xiàn)在包括,提供有關(guān)形狀評分和藥效團(tuán)特征特性的詳細(xì)信息;

 

(4)動力學(xué)(Production)、動力學(xué)(NAMD)、GaMD平衡和GaMD Production協(xié)議進(jìn)行了更新,包括改進(jìn)的參數(shù)驗證,以及對時間步長參數(shù)的修改,縮小選擇范圍到特定范圍內(nèi)的離散增量;

 

(5)提前安裝Pipeline Pilot 2024;

 

(6)改進(jìn)了Align Sequence Profiles(Align 123)協(xié)議中Use Secondary Structure參數(shù)的幫助文本,并在選擇DSC或TRANSMEM二級結(jié)構(gòu)進(jìn)行對齊時,如果沒有提供正確的二級結(jié)構(gòu)輸入,則增加了錯誤處理信息;

 

(7)以下協(xié)議不能從Discovery Studio客戶端訪問:更新抗體數(shù)據(jù)庫、下載BLAST DB文件、更新BLAST數(shù)據(jù)庫、構(gòu)建PDB引用數(shù)據(jù)和自定義Discovery Studio模板。只能從Pipeline Pilot Professional客戶端訪問;

 

(8)Intel MPI升級到2021.10;

 

(9)Qt Windows庫更新到5.15.14版本,以解決安全漏洞;

 

(10)PharmaDB Profiler協(xié)議報告每個唯一函數(shù)的映射詳細(xì)信息,PharmaDB Filter協(xié)議支持使用pdb_id和scpdb_id進(jìn)行過濾;

 

修補(bǔ)功能:

(1)當(dāng)平臺參數(shù)設(shè)置為GPU時,Dock Proteins(ZDOCK)協(xié)議在Windows上不再失??;

 

(2)從默認(rèn)值修改Tolerance參數(shù)后,Create 3D Fingerprint協(xié)議不再失?。?/span>

 

(3)使用指定為快捷路徑的重新啟動文件從Pipeline Pilot Professional客戶端運(yùn)行時,Dynamics(生產(chǎn))和Dynamics(平衡)協(xié)議不再失??;

 

(4)分配力場協(xié)議不再為相應(yīng)力場RTF中具有兩個字母元素符號的原子生成不正確的原子排序;

 

(5)分配力場協(xié)議使用力場數(shù)據(jù)更新結(jié)構(gòu);

 

(6)Discovery Studio客戶端中的PDB Ligand Bond Orders腳本可以正常工作;

 

(7)如果疊加算法無法收斂,測量軌跡特征、自由能預(yù)測和簇一致性協(xié)議會產(chǎn)生錯誤,修改原子選擇或參考構(gòu)象可以解決此錯誤;

 

(8)作業(yè)描述參數(shù)將從MATCH協(xié)議的分配力字段和類型配體中刪除。這不會影響協(xié)議的功能;

 

(9)Predict Humanization Mutations協(xié)議將查詢序列的名稱包含在最終消息中;

 

(10)2023 SP1的新主題和產(chǎn)品發(fā)布文檔中的一個條目錯誤地說明了RCSB結(jié)構(gòu)搜索協(xié)議使用的最新更新的殘基數(shù)據(jù)庫中的殘基數(shù)量。先前版本部分中的相關(guān)條目已修復(fù),以指示正確的數(shù)字40322;

 

(11)刪除了在Discovery Studio客戶端中導(dǎo)入?yún)f(xié)議的功能,以解決安全漏洞。您可以使用Pipeline Pilot Professional客戶端將協(xié)議導(dǎo)入服務(wù)器;

 

(12)Perl腳本示例代碼,MarkSideChainFormationViolations,按預(yù)期在Linux操作系統(tǒng)上的Discovery Studio客戶端上運(yùn)行;

 

(13)重新啟動模擬后,動力學(xué)(Production)協(xié)議現(xiàn)在可以正確報告進(jìn)度;

 

(14)在MSLD Bias Optimization and Production協(xié)議中,當(dāng)Use BLaDE參數(shù)設(shè)置為False時,可以將“Number of Cores per Simulation”參數(shù)設(shè)置為1;

 

(15)“打開URL”對話框中的Discovery Studio客戶端PDB配體默認(rèn)位點(diǎn)定義不再受RCSB支持,并且已從默認(rèn)URL位置首選項中刪除。但是,如果從早期版本的Discovery Studio導(dǎo)入了首選項,則此選項仍可能出現(xiàn)。您可以在Edit >Preferences>Files Explorer>“URL位置”頁面中刪除它們;

 

(16)Discovery Studio客戶端顯示“增強(qiáng)的采樣”工具面板;

 

(17)Discovery Studio客戶端中顯示了大分子偶極矩監(jiān)測器的標(biāo)簽;

 

關(guān)于北京泰科:

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北京泰科博思科技有限公司擁有一支一流的技術(shù)服務(wù)團(tuán)隊和資深的專家咨詢團(tuán)隊,以客戶真正需求出發(fā),服務(wù)客戶,為客戶創(chuàng)造價值。我們秉承“職業(yè)、敬業(yè)、擔(dān)當(dāng)、拼搏、合作”的企業(yè)精神,致力于用國際領(lǐng)先的軟件產(chǎn)品和專業(yè)全面的技術(shù)支持服務(wù),成為客戶可信賴的合作伙伴。

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